Cette recherche analyse les difficultés d'application des programmes des Sciences de la Vie et de la Terre (SVT) et l'Approche par situation (APS) en classe de 7ème et de 8ème années en RDC. En effet, dans le souci d'améliorer la qualité du système éducatif national, d'importantes réformes convergentes ont conduit à l'élaboration des programmes éducatifs du Domaine d'Apprentissage des Sciences afin de doter tous les jeunes des capacités d'utiliser efficacement les compétences acquises. Bien que ces programmes aient fait l'objet d'une implémentation, une validation et une généralisation leur appropriation par les enseignants reste problématique. L'objectif de cette étude est d'analyser les principales difficultés auxquelles les enseignants sont confrontés en classe des SVT. Cette recherche adopte une méthodologie mixte intégrant des analyses qualitatives et quantitatives pour une compréhension approfondie du thème étudié. L'entretien, le questionnaire et la recherche documentaire sont des techniques utilisées pour récolter les données. Les résultats révèlent que 60 % d'enseignants déclarent ne pas avoir bénéficié de formation à l'utilisation des programmes et l'approche. Le manque des matériels pédagogiques, les classes pléthoriques rendent difficiles le bon déroulement des séquences pédagogiques. En conclusion, une formation initiale et continue des enseignants et de meilleures conditions de travail sont nécessaires.