Au cœur du programme québécois d’histoire au secondaire, la pensée historienne et la pensée critique constituent des axes structurants de la formation citoyenne, qui ont notamment été conceptualisés par Seixas et Morton (2013). Dans cette perspective, les manuels scolaires demeurent des médiations privilégiées entre le programme et les pratiques de classe, contribuant potentiellement au développement des opérations mentales disciplinaires attendues chez les élèves. Après plusieurs années de mise en œuvre du Programme de formation de l’école québécoise (PFEQ) (Québec, 2017), nous avons entrepris une analyse visant à décrire et à étayer par des preuves la présence, la conception et l’opérationnalisation de la pensée historienne dans les manuels scolaires approuvés par l’État. Dans cette contribution, il s’agit d’exposer les résultats partiels d’une analyse lexicale et interprétative de contenu de quatre manuels de 3ᵉ et 4ᵉ secondaire. Cette démarche permet de circonscrire les points d’ancrage conceptuels entre ces manuels et les dimensions de la pensée historienne, tout en formulant des recommandations relatives aux écarts constatés entre le cadre théorique et les pratiques éditoriales observées.